Protein–RNA interactions for Protein: P35951

Ldlr, Low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdlrP35951 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LdlrP35951 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LdlrP35951 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LdlrP35951 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LdlrP35951 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LdlrP35951 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LdlrP35951 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LdlrP35951 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LdlrP35951 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LdlrP35951 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LdlrP35951 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LdlrP35951 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LdlrP35951 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LdlrP35951 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LdlrP35951 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LdlrP35951 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LdlrP35951 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LdlrP35951 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LdlrP35951 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LdlrP35951 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LdlrP35951 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LdlrP35951 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LdlrP35951 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LdlrP35951 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LdlrP35951 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LdlrP35951 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LdlrP35951 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LdlrP35951 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LdlrP35951 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LdlrP35951 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LdlrP35951 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LdlrP35951 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LdlrP35951 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LdlrP35951 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LdlrP35951 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LdlrP35951 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LdlrP35951 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LdlrP35951 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LdlrP35951 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LdlrP35951 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LdlrP35951 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LdlrP35951 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LdlrP35951 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LdlrP35951 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LdlrP35951 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LdlrP35951 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LdlrP35951 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LdlrP35951 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LdlrP35951 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LdlrP35951 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LdlrP35951 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LdlrP35951 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LdlrP35951 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LdlrP35951 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LdlrP35951 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LdlrP35951 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LdlrP35951 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LdlrP35951 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LdlrP35951 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LdlrP35951 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LdlrP35951 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LdlrP35951 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LdlrP35951 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LdlrP35951 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LdlrP35951 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LdlrP35951 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LdlrP35951 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LdlrP35951 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LdlrP35951 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LdlrP35951 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LdlrP35951 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LdlrP35951 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LdlrP35951 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LdlrP35951 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LdlrP35951 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LdlrP35951 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LdlrP35951 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LdlrP35951 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LdlrP35951 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LdlrP35951 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LdlrP35951 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LdlrP35951 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LdlrP35951 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LdlrP35951 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LdlrP35951 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LdlrP35951 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LdlrP35951 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LdlrP35951 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LdlrP35951 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LdlrP35951 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LdlrP35951 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LdlrP35951 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LdlrP35951 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LdlrP35951 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LdlrP35951 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LdlrP35951 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LdlrP35951 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LdlrP35951 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LdlrP35951 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LdlrP35951 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms