Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Pola1P33609 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pola1P33609 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Pola1P33609 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Pola1P33609 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Pola1P33609 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Pola1P33609 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pola1P33609 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pola1P33609 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pola1P33609 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pola1P33609 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Pola1P33609 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pola1P33609 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pola1P33609 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Pola1P33609 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Pola1P33609 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pola1P33609 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pola1P33609 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pola1P33609 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pola1P33609 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Pola1P33609 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pola1P33609 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pola1P33609 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pola1P33609 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pola1P33609 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Pola1P33609 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Pola1P33609 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Pola1P33609 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Pola1P33609 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Pola1P33609 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Pola1P33609 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pola1P33609 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Pola1P33609 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pola1P33609 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Pola1P33609 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Pola1P33609 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Pola1P33609 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Pola1P33609 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Pola1P33609 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Pola1P33609 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Pola1P33609 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Pola1P33609 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pola1P33609 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pola1P33609 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pola1P33609 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pola1P33609 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Pola1P33609 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Pola1P33609 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Pola1P33609 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pola1P33609 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pola1P33609 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pola1P33609 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pola1P33609 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pola1P33609 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pola1P33609 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pola1P33609 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pola1P33609 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pola1P33609 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pola1P33609 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pola1P33609 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Pola1P33609 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Pola1P33609 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Pola1P33609 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Pola1P33609 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Pola1P33609 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Pola1P33609 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pola1P33609 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Pola1P33609 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Pola1P33609 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pola1P33609 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pola1P33609 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pola1P33609 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pola1P33609 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pola1P33609 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pola1P33609 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pola1P33609 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pola1P33609 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pola1P33609 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pola1P33609 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Pola1P33609 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Pola1P33609 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pola1P33609 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pola1P33609 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pola1P33609 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pola1P33609 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pola1P33609 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pola1P33609 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pola1P33609 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pola1P33609 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Pola1P33609 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pola1P33609 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pola1P33609 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Pola1P33609 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Pola1P33609 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pola1P33609 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pola1P33609 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pola1P33609 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pola1P33609 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pola1P33609 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pola1P33609 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms