Protein–RNA interactions for Protein: P32020

Scp2, Non-specific lipid-transfer protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2P32020 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scp2P32020 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scp2P32020 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Scp2P32020 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scp2P32020 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scp2P32020 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scp2P32020 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scp2P32020 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Scp2P32020 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scp2P32020 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scp2P32020 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Scp2P32020 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scp2P32020 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scp2P32020 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scp2P32020 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scp2P32020 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scp2P32020 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scp2P32020 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Scp2P32020 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scp2P32020 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scp2P32020 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scp2P32020 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Scp2P32020 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Scp2P32020 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scp2P32020 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Scp2P32020 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scp2P32020 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scp2P32020 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scp2P32020 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scp2P32020 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scp2P32020 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scp2P32020 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scp2P32020 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scp2P32020 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scp2P32020 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scp2P32020 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scp2P32020 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scp2P32020 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scp2P32020 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scp2P32020 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scp2P32020 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scp2P32020 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scp2P32020 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Scp2P32020 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scp2P32020 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scp2P32020 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scp2P32020 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Scp2P32020 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scp2P32020 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Scp2P32020 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scp2P32020 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scp2P32020 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scp2P32020 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scp2P32020 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scp2P32020 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scp2P32020 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Scp2P32020 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scp2P32020 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scp2P32020 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scp2P32020 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scp2P32020 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scp2P32020 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scp2P32020 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scp2P32020 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scp2P32020 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scp2P32020 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scp2P32020 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Scp2P32020 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scp2P32020 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scp2P32020 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scp2P32020 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scp2P32020 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scp2P32020 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scp2P32020 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Scp2P32020 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scp2P32020 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scp2P32020 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scp2P32020 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scp2P32020 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scp2P32020 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scp2P32020 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scp2P32020 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scp2P32020 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scp2P32020 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scp2P32020 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scp2P32020 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scp2P32020 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scp2P32020 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scp2P32020 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scp2P32020 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scp2P32020 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scp2P32020 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scp2P32020 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scp2P32020 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scp2P32020 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scp2P32020 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scp2P32020 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scp2P32020 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scp2P32020 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scp2P32020 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.4 ms