Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc11P31313 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc11P31313 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc11P31313 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc11P31313 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc11P31313 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc11P31313 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc11P31313 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc11P31313 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc11P31313 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc11P31313 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc11P31313 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc11P31313 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc11P31313 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc11P31313 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc11P31313 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc11P31313 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc11P31313 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc11P31313 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc11P31313 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc11P31313 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc11P31313 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc11P31313 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc11P31313 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc11P31313 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc11P31313 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc11P31313 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc11P31313 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc11P31313 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc11P31313 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc11P31313 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc11P31313 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc11P31313 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc11P31313 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc11P31313 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc11P31313 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc11P31313 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc11P31313 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc11P31313 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc11P31313 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc11P31313 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc11P31313 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc11P31313 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc11P31313 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc11P31313 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc11P31313 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc11P31313 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc11P31313 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc11P31313 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc11P31313 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc11P31313 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc11P31313 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc11P31313 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc11P31313 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hoxc11P31313 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc11P31313 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc11P31313 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc11P31313 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc11P31313 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc11P31313 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc11P31313 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc11P31313 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc11P31313 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc11P31313 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc11P31313 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc11P31313 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc11P31313 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc11P31313 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc11P31313 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc11P31313 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc11P31313 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc11P31313 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc11P31313 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc11P31313 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc11P31313 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc11P31313 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc11P31313 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms