Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vcam1P29533 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vcam1P29533 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Vcam1P29533 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Vcam1P29533 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vcam1P29533 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vcam1P29533 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vcam1P29533 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vcam1P29533 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vcam1P29533 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vcam1P29533 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vcam1P29533 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vcam1P29533 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vcam1P29533 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vcam1P29533 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vcam1P29533 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vcam1P29533 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vcam1P29533 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vcam1P29533 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vcam1P29533 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vcam1P29533 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Vcam1P29533 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vcam1P29533 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Vcam1P29533 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vcam1P29533 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vcam1P29533 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vcam1P29533 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vcam1P29533 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vcam1P29533 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vcam1P29533 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Vcam1P29533 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vcam1P29533 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vcam1P29533 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vcam1P29533 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vcam1P29533 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vcam1P29533 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vcam1P29533 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vcam1P29533 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vcam1P29533 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vcam1P29533 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vcam1P29533 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vcam1P29533 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vcam1P29533 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vcam1P29533 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vcam1P29533 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vcam1P29533 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vcam1P29533 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Vcam1P29533 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vcam1P29533 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vcam1P29533 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vcam1P29533 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Vcam1P29533 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vcam1P29533 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vcam1P29533 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vcam1P29533 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vcam1P29533 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Vcam1P29533 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vcam1P29533 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vcam1P29533 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vcam1P29533 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vcam1P29533 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vcam1P29533 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vcam1P29533 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Vcam1P29533 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vcam1P29533 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vcam1P29533 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vcam1P29533 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vcam1P29533 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vcam1P29533 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vcam1P29533 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vcam1P29533 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vcam1P29533 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vcam1P29533 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vcam1P29533 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vcam1P29533 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vcam1P29533 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vcam1P29533 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Vcam1P29533 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vcam1P29533 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Vcam1P29533 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Vcam1P29533 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Vcam1P29533 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vcam1P29533 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vcam1P29533 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vcam1P29533 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vcam1P29533 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vcam1P29533 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vcam1P29533 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vcam1P29533 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vcam1P29533 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vcam1P29533 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vcam1P29533 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Vcam1P29533 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Vcam1P29533 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Vcam1P29533 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vcam1P29533 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vcam1P29533 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vcam1P29533 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Vcam1P29533 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vcam1P29533 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms