Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HexaP29416 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HexaP29416 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HexaP29416 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HexaP29416 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HexaP29416 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HexaP29416 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HexaP29416 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HexaP29416 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HexaP29416 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HexaP29416 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HexaP29416 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HexaP29416 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HexaP29416 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HexaP29416 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HexaP29416 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HexaP29416 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HexaP29416 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HexaP29416 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HexaP29416 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HexaP29416 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HexaP29416 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HexaP29416 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HexaP29416 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HexaP29416 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HexaP29416 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HexaP29416 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HexaP29416 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HexaP29416 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HexaP29416 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HexaP29416 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HexaP29416 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HexaP29416 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HexaP29416 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HexaP29416 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HexaP29416 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HexaP29416 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HexaP29416 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HexaP29416 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HexaP29416 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HexaP29416 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HexaP29416 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HexaP29416 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HexaP29416 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HexaP29416 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HexaP29416 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HexaP29416 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HexaP29416 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HexaP29416 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HexaP29416 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HexaP29416 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HexaP29416 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HexaP29416 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HexaP29416 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HexaP29416 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HexaP29416 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HexaP29416 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HexaP29416 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HexaP29416 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HexaP29416 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HexaP29416 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HexaP29416 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HexaP29416 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HexaP29416 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HexaP29416 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HexaP29416 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HexaP29416 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HexaP29416 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HexaP29416 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HexaP29416 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HexaP29416 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HexaP29416 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HexaP29416 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HexaP29416 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HexaP29416 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HexaP29416 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HexaP29416 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HexaP29416 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HexaP29416 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HexaP29416 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HexaP29416 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HexaP29416 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HexaP29416 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HexaP29416 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HexaP29416 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HexaP29416 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HexaP29416 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HexaP29416 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HexaP29416 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HexaP29416 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HexaP29416 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HexaP29416 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HexaP29416 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HexaP29416 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HexaP29416 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HexaP29416 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HexaP29416 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HexaP29416 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HexaP29416 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HexaP29416 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms