Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Col2a1P28481 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col2a1P28481 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col2a1P28481 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Col2a1P28481 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col2a1P28481 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col2a1P28481 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col2a1P28481 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col2a1P28481 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col2a1P28481 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Col2a1P28481 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col2a1P28481 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col2a1P28481 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Col2a1P28481 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Col2a1P28481 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col2a1P28481 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col2a1P28481 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col2a1P28481 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col2a1P28481 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col2a1P28481 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Col2a1P28481 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col2a1P28481 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col2a1P28481 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col2a1P28481 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col2a1P28481 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col2a1P28481 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col2a1P28481 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col2a1P28481 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col2a1P28481 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col2a1P28481 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col2a1P28481 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Col2a1P28481 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col2a1P28481 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col2a1P28481 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col2a1P28481 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col2a1P28481 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col2a1P28481 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col2a1P28481 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col2a1P28481 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Col2a1P28481 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Col2a1P28481 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col2a1P28481 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col2a1P28481 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col2a1P28481 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col2a1P28481 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col2a1P28481 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col2a1P28481 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col2a1P28481 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col2a1P28481 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col2a1P28481 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col2a1P28481 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col2a1P28481 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col2a1P28481 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col2a1P28481 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col2a1P28481 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Col2a1P28481 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Col2a1P28481 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Col2a1P28481 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col2a1P28481 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col2a1P28481 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col2a1P28481 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Col2a1P28481 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col2a1P28481 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col2a1P28481 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col2a1P28481 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col2a1P28481 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col2a1P28481 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col2a1P28481 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col2a1P28481 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col2a1P28481 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col2a1P28481 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col2a1P28481 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col2a1P28481 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col2a1P28481 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col2a1P28481 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col2a1P28481 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Col2a1P28481 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col2a1P28481 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col2a1P28481 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col2a1P28481 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Col2a1P28481 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col2a1P28481 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col2a1P28481 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col2a1P28481 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Col2a1P28481 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col2a1P28481 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col2a1P28481 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col2a1P28481 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Col2a1P28481 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Col2a1P28481 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col2a1P28481 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Col2a1P28481 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col2a1P28481 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col2a1P28481 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col2a1P28481 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col2a1P28481 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col2a1P28481 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Col2a1P28481 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col2a1P28481 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col2a1P28481 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms