Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa2P28309 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa2P28309 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa2P28309 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa2P28309 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa2P28309 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa2P28309 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa2P28309 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa2P28309 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa2P28309 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa2P28309 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa2P28309 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa2P28309 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa2P28309 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa2P28309 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa2P28309 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa2P28309 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa2P28309 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa2P28309 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa2P28309 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa2P28309 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa2P28309 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa2P28309 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa2P28309 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa2P28309 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa2P28309 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa2P28309 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa2P28309 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa2P28309 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms