Protein–RNA interactions for Protein: P26450

Pik3r1, Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3r1P26450 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pik3r1P26450 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pik3r1P26450 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Pik3r1P26450 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pik3r1P26450 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pik3r1P26450 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pik3r1P26450 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pik3r1P26450 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Pik3r1P26450 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pik3r1P26450 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pik3r1P26450 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pik3r1P26450 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pik3r1P26450 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pik3r1P26450 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pik3r1P26450 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pik3r1P26450 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pik3r1P26450 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pik3r1P26450 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pik3r1P26450 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pik3r1P26450 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pik3r1P26450 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pik3r1P26450 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pik3r1P26450 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pik3r1P26450 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pik3r1P26450 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pik3r1P26450 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pik3r1P26450 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pik3r1P26450 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pik3r1P26450 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pik3r1P26450 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pik3r1P26450 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pik3r1P26450 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Pik3r1P26450 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pik3r1P26450 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pik3r1P26450 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Pik3r1P26450 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pik3r1P26450 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pik3r1P26450 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pik3r1P26450 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Pik3r1P26450 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pik3r1P26450 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Pik3r1P26450 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pik3r1P26450 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pik3r1P26450 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pik3r1P26450 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Pik3r1P26450 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pik3r1P26450 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pik3r1P26450 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pik3r1P26450 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pik3r1P26450 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pik3r1P26450 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pik3r1P26450 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Pik3r1P26450 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pik3r1P26450 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Pik3r1P26450 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pik3r1P26450 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pik3r1P26450 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pik3r1P26450 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pik3r1P26450 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pik3r1P26450 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pik3r1P26450 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pik3r1P26450 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pik3r1P26450 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pik3r1P26450 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pik3r1P26450 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pik3r1P26450 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pik3r1P26450 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pik3r1P26450 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pik3r1P26450 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pik3r1P26450 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pik3r1P26450 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pik3r1P26450 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pik3r1P26450 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pik3r1P26450 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pik3r1P26450 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pik3r1P26450 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pik3r1P26450 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pik3r1P26450 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pik3r1P26450 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pik3r1P26450 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pik3r1P26450 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pik3r1P26450 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pik3r1P26450 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pik3r1P26450 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pik3r1P26450 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pik3r1P26450 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pik3r1P26450 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pik3r1P26450 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pik3r1P26450 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pik3r1P26450 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pik3r1P26450 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pik3r1P26450 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pik3r1P26450 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pik3r1P26450 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pik3r1P26450 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pik3r1P26450 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pik3r1P26450 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pik3r1P26450 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pik3r1P26450 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pik3r1P26450 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms