Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcaP20444 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcaP20444 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcaP20444 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcaP20444 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcaP20444 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcaP20444 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcaP20444 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcaP20444 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcaP20444 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcaP20444 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkcaP20444 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcaP20444 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrkcaP20444 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcaP20444 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcaP20444 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcaP20444 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcaP20444 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcaP20444 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PrkcaP20444 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcaP20444 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcaP20444 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcaP20444 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcaP20444 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcaP20444 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcaP20444 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PrkcaP20444 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcaP20444 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcaP20444 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcaP20444 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcaP20444 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcaP20444 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcaP20444 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcaP20444 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkcaP20444 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkcaP20444 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcaP20444 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcaP20444 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcaP20444 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcaP20444 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcaP20444 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcaP20444 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcaP20444 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcaP20444 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcaP20444 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcaP20444 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcaP20444 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcaP20444 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcaP20444 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PrkcaP20444 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms