Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gata1P17679 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gata1P17679 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gata1P17679 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gata1P17679 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gata1P17679 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gata1P17679 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata1P17679 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata1P17679 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gata1P17679 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gata1P17679 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gata1P17679 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gata1P17679 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gata1P17679 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gata1P17679 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gata1P17679 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gata1P17679 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms