Protein–RNA interactions for Protein: P17534

Defa-rs2, Alpha-defensin-related sequence 2, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs2P17534 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Defa-rs2P17534 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Defa-rs2P17534 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Defa-rs2P17534 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Defa-rs2P17534 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Defa-rs2P17534 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Defa-rs2P17534 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Defa-rs2P17534 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Defa-rs2P17534 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Defa-rs2P17534 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Defa-rs2P17534 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Defa-rs2P17534 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Defa-rs2P17534 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Defa-rs2P17534 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Defa-rs2P17534 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Defa-rs2P17534 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Defa-rs2P17534 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Defa-rs2P17534 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Defa-rs2P17534 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Defa-rs2P17534 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Defa-rs2P17534 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Defa-rs2P17534 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Defa-rs2P17534 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Defa-rs2P17534 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Defa-rs2P17534 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Defa-rs2P17534 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Defa-rs2P17534 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Defa-rs2P17534 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Defa-rs2P17534 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Defa-rs2P17534 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Defa-rs2P17534 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Defa-rs2P17534 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Defa-rs2P17534 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Defa-rs2P17534 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Defa-rs2P17534 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Defa-rs2P17534 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Defa-rs2P17534 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Defa-rs2P17534 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Defa-rs2P17534 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Defa-rs2P17534 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Defa-rs2P17534 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Defa-rs2P17534 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Defa-rs2P17534 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Defa-rs2P17534 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Defa-rs2P17534 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Defa-rs2P17534 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Defa-rs2P17534 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Defa-rs2P17534 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Defa-rs2P17534 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Defa-rs2P17534 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Defa-rs2P17534 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Defa-rs2P17534 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Defa-rs2P17534 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Defa-rs2P17534 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Defa-rs2P17534 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Defa-rs2P17534 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Defa-rs2P17534 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Defa-rs2P17534 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Defa-rs2P17534 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Defa-rs2P17534 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Defa-rs2P17534 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Defa-rs2P17534 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Defa-rs2P17534 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Defa-rs2P17534 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Defa-rs2P17534 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Defa-rs2P17534 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Defa-rs2P17534 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Defa-rs2P17534 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Defa-rs2P17534 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Defa-rs2P17534 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Defa-rs2P17534 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Defa-rs2P17534 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Defa-rs2P17534 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Defa-rs2P17534 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Defa-rs2P17534 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Defa-rs2P17534 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Defa-rs2P17534 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Defa-rs2P17534 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Defa-rs2P17534 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Defa-rs2P17534 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Defa-rs2P17534 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Defa-rs2P17534 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Defa-rs2P17534 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Defa-rs2P17534 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Defa-rs2P17534 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Defa-rs2P17534 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Defa-rs2P17534 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Defa-rs2P17534 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Defa-rs2P17534 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Defa-rs2P17534 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Defa-rs2P17534 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Defa-rs2P17534 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Defa-rs2P17534 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Defa-rs2P17534 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Defa-rs2P17534 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Defa-rs2P17534 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Defa-rs2P17534 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Defa-rs2P17534 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Defa-rs2P17534 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Defa-rs2P17534 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms