Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Defa-rs1P17533 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Defa-rs1P17533 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Defa-rs1P17533 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Defa-rs1P17533 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Defa-rs1P17533 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Defa-rs1P17533 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Defa-rs1P17533 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Defa-rs1P17533 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa-rs1P17533 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa-rs1P17533 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa-rs1P17533 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa-rs1P17533 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa-rs1P17533 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa-rs1P17533 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Defa-rs1P17533 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Defa-rs1P17533 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Defa-rs1P17533 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Defa-rs1P17533 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Defa-rs1P17533 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Defa-rs1P17533 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Defa-rs1P17533 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Defa-rs1P17533 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Defa-rs1P17533 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Defa-rs1P17533 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Defa-rs1P17533 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Defa-rs1P17533 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Defa-rs1P17533 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Defa-rs1P17533 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Defa-rs1P17533 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Defa-rs1P17533 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Defa-rs1P17533 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Defa-rs1P17533 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Defa-rs1P17533 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Defa-rs1P17533 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Defa-rs1P17533 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Defa-rs1P17533 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Defa-rs1P17533 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Defa-rs1P17533 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Defa-rs1P17533 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Defa-rs1P17533 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Defa-rs1P17533 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Defa-rs1P17533 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Defa-rs1P17533 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Defa-rs1P17533 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Defa-rs1P17533 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa-rs1P17533 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa-rs1P17533 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa-rs1P17533 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa-rs1P17533 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa-rs1P17533 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Defa-rs1P17533 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa-rs1P17533 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa-rs1P17533 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Defa-rs1P17533 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Defa-rs1P17533 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Defa-rs1P17533 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Defa-rs1P17533 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms