Protein–RNA interactions for Protein: P16951

Atf2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf2P16951 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atf2P16951 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atf2P16951 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atf2P16951 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf2P16951 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf2P16951 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf2P16951 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf2P16951 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf2P16951 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf2P16951 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf2P16951 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf2P16951 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf2P16951 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf2P16951 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atf2P16951 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atf2P16951 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atf2P16951 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atf2P16951 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf2P16951 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf2P16951 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf2P16951 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atf2P16951 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atf2P16951 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf2P16951 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf2P16951 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf2P16951 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf2P16951 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atf2P16951 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atf2P16951 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf2P16951 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf2P16951 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf2P16951 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf2P16951 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf2P16951 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf2P16951 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf2P16951 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atf2P16951 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf2P16951 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf2P16951 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf2P16951 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf2P16951 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf2P16951 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf2P16951 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf2P16951 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf2P16951 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf2P16951 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf2P16951 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf2P16951 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf2P16951 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf2P16951 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atf2P16951 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atf2P16951 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atf2P16951 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atf2P16951 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atf2P16951 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atf2P16951 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atf2P16951 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atf2P16951 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atf2P16951 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atf2P16951 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atf2P16951 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atf2P16951 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atf2P16951 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atf2P16951 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atf2P16951 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atf2P16951 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atf2P16951 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atf2P16951 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atf2P16951 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atf2P16951 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atf2P16951 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atf2P16951 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atf2P16951 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atf2P16951 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf2P16951 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf2P16951 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf2P16951 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf2P16951 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf2P16951 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf2P16951 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf2P16951 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf2P16951 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf2P16951 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf2P16951 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf2P16951 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf2P16951 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf2P16951 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf2P16951 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf2P16951 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf2P16951 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf2P16951 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf2P16951 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf2P16951 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf2P16951 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf2P16951 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf2P16951 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf2P16951 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf2P16951 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf2P16951 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf2P16951 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms