Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme1P15532 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme1P15532 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme1P15532 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme1P15532 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme1P15532 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme1P15532 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme1P15532 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme1P15532 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme1P15532 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nme1P15532 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nme1P15532 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme1P15532 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme1P15532 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme1P15532 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme1P15532 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme1P15532 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme1P15532 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme1P15532 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme1P15532 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme1P15532 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme1P15532 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme1P15532 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme1P15532 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme1P15532 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme1P15532 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme1P15532 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme1P15532 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nme1P15532 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nme1P15532 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme1P15532 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nme1P15532 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nme1P15532 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nme1P15532 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nme1P15532 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nme1P15532 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nme1P15532 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nme1P15532 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nme1P15532 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nme1P15532 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nme1P15532 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nme1P15532 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nme1P15532 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nme1P15532 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nme1P15532 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nme1P15532 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nme1P15532 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nme1P15532 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nme1P15532 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nme1P15532 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nme1P15532 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nme1P15532 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme1P15532 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme1P15532 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme1P15532 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nme1P15532 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nme1P15532 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nme1P15532 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nme1P15532 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nme1P15532 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nme1P15532 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nme1P15532 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nme1P15532 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nme1P15532 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nme1P15532 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nme1P15532 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nme1P15532 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nme1P15532 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nme1P15532 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nme1P15532 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nme1P15532 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nme1P15532 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nme1P15532 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nme1P15532 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nme1P15532 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme1P15532 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme1P15532 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme1P15532 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme1P15532 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme1P15532 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme1P15532 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme1P15532 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme1P15532 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme1P15532 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme1P15532 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme1P15532 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme1P15532 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme1P15532 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme1P15532 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme1P15532 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme1P15532 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme1P15532 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme1P15532 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nme1P15532 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme1P15532 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme1P15532 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme1P15532 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme1P15532 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme1P15532 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme1P15532 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms