Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Nr4a1P12813 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr4a1P12813 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr4a1P12813 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr4a1P12813 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr4a1P12813 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr4a1P12813 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr4a1P12813 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr4a1P12813 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr4a1P12813 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr4a1P12813 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr4a1P12813 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr4a1P12813 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr4a1P12813 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr4a1P12813 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr4a1P12813 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr4a1P12813 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr4a1P12813 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr4a1P12813 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr4a1P12813 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr4a1P12813 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr4a1P12813 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr4a1P12813 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr4a1P12813 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr4a1P12813 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr4a1P12813 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr4a1P12813 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr4a1P12813 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr4a1P12813 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr4a1P12813 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr4a1P12813 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr4a1P12813 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr4a1P12813 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr4a1P12813 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr4a1P12813 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr4a1P12813 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr4a1P12813 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr4a1P12813 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr4a1P12813 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr4a1P12813 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr4a1P12813 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr4a1P12813 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nr4a1P12813 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr4a1P12813 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr4a1P12813 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr4a1P12813 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr4a1P12813 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr4a1P12813 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr4a1P12813 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr4a1P12813 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr4a1P12813 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr4a1P12813 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr4a1P12813 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr4a1P12813 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr4a1P12813 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr4a1P12813 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr4a1P12813 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr4a1P12813 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr4a1P12813 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr4a1P12813 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr4a1P12813 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr4a1P12813 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr4a1P12813 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr4a1P12813 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr4a1P12813 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr4a1P12813 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nr4a1P12813 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr4a1P12813 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr4a1P12813 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr4a1P12813 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr4a1P12813 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr4a1P12813 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr4a1P12813 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr4a1P12813 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr4a1P12813 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr4a1P12813 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr4a1P12813 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr4a1P12813 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr4a1P12813 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr4a1P12813 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nr4a1P12813 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nr4a1P12813 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nr4a1P12813 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nr4a1P12813 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms