Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnp2P11378 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnp2P11378 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnp2P11378 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnp2P11378 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnp2P11378 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnp2P11378 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnp2P11378 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnp2P11378 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnp2P11378 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnp2P11378 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnp2P11378 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnp2P11378 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnp2P11378 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnp2P11378 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnp2P11378 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnp2P11378 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnp2P11378 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnp2P11378 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnp2P11378 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnp2P11378 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnp2P11378 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnp2P11378 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnp2P11378 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnp2P11378 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnp2P11378 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnp2P11378 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnp2P11378 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnp2P11378 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnp2P11378 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnp2P11378 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnp2P11378 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnp2P11378 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnp2P11378 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnp2P11378 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnp2P11378 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnp2P11378 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnp2P11378 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms