Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P10404 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P10404 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P10404 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P10404 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
P10404 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P10404 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P10404 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P10404 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P10404 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P10404 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P10404 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P10404 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P10404 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P10404 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P10404 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P10404 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P10404 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
P10404 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
P10404 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P10404 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P10404 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P10404 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P10404 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P10404 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P10404 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P10404 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P10404 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P10404 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
P10404 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P10404 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P10404 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P10404 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P10404 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P10404 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P10404 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P10404 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
P10404 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P10404 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P10404 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P10404 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P10404 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P10404 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P10404 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P10404 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P10404 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P10404 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P10404 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P10404 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P10404 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P10404 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P10404 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P10404 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P10404 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P10404 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P10404 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P10404 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P10404 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P10404 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P10404 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P10404 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
P10404 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P10404 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P10404 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
P10404 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P10404 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P10404 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P10404 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P10404 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
P10404 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P10404 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P10404 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P10404 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P10404 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P10404 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
P10404 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
P10404 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
P10404 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
P10404 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P10404 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P10404 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P10404 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P10404 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P10404 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P10404 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P10404 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
P10404 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P10404 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P10404 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P10404 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
P10404 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
P10404 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
P10404 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
P10404 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
P10404 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
P10404 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
P10404 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
P10404 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
P10404 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P10404 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms