Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ndufb1P0DN34 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufb1P0DN34 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb1P0DN34 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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