Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxb8P09632 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxb8P09632 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxb8P09632 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxb8P09632 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxb8P09632 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxb8P09632 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxb8P09632 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxb8P09632 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxb8P09632 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hoxb8P09632 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxb8P09632 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxb8P09632 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxb8P09632 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxb8P09632 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxb8P09632 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxb8P09632 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxb8P09632 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxb8P09632 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxb8P09632 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxb8P09632 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxb8P09632 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxb8P09632 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxb8P09632 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxb8P09632 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxb8P09632 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxb8P09632 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxb8P09632 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Hoxb8P09632 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxb8P09632 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxb8P09632 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxb8P09632 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxb8P09632 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxb8P09632 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxb8P09632 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxb8P09632 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxb8P09632 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxb8P09632 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxb8P09632 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxb8P09632 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxb8P09632 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxb8P09632 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxb8P09632 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxb8P09632 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxb8P09632 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxb8P09632 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxb8P09632 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxb8P09632 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxb8P09632 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxb8P09632 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxb8P09632 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxb8P09632 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxb8P09632 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxb8P09632 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxb8P09632 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxb8P09632 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxb8P09632 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxb8P09632 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb8P09632 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb8P09632 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb8P09632 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb8P09632 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb8P09632 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb8P09632 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxb8P09632 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxb8P09632 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxb8P09632 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxb8P09632 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb8P09632 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb8P09632 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb8P09632 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb8P09632 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxb8P09632 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxb8P09632 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hoxb8P09632 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hoxb8P09632 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hoxb8P09632 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxb8P09632 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxb8P09632 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxb8P09632 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxb8P09632 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxb8P09632 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb8P09632 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxb8P09632 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxb8P09632 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxb8P09632 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxb8P09632 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxb8P09632 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxb8P09632 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb8P09632 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb8P09632 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb8P09632 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb8P09632 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb8P09632 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb8P09632 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb8P09632 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb8P09632 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxb8P09632 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxb8P09632 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxb8P09632 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms