Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifna5P07349 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifna5P07349 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifna5P07349 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifna5P07349 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifna5P07349 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifna5P07349 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifna5P07349 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifna5P07349 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifna5P07349 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ifna5P07349 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifna5P07349 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifna5P07349 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ifna5P07349 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna5P07349 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna5P07349 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna5P07349 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna5P07349 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna5P07349 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna5P07349 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifna5P07349 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifna5P07349 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifna5P07349 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifna5P07349 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifna5P07349 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifna5P07349 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifna5P07349 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna5P07349 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna5P07349 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna5P07349 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna5P07349 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ifna5P07349 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ifna5P07349 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna5P07349 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna5P07349 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna5P07349 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna5P07349 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna5P07349 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna5P07349 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifna5P07349 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifna5P07349 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifna5P07349 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifna5P07349 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifna5P07349 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifna5P07349 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifna5P07349 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms