Protein–RNA interactions for Protein: P06879

Prl, Prolactin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlP06879 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrlP06879 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrlP06879 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrlP06879 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrlP06879 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrlP06879 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrlP06879 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PrlP06879 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PrlP06879 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PrlP06879 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrlP06879 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrlP06879 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrlP06879 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrlP06879 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrlP06879 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrlP06879 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrlP06879 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrlP06879 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrlP06879 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PrlP06879 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrlP06879 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrlP06879 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrlP06879 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PrlP06879 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrlP06879 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrlP06879 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrlP06879 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrlP06879 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrlP06879 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrlP06879 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrlP06879 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrlP06879 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrlP06879 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrlP06879 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrlP06879 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrlP06879 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrlP06879 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PrlP06879 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrlP06879 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrlP06879 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrlP06879 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrlP06879 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrlP06879 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrlP06879 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrlP06879 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrlP06879 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrlP06879 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrlP06879 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrlP06879 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrlP06879 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrlP06879 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrlP06879 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrlP06879 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrlP06879 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrlP06879 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrlP06879 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrlP06879 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrlP06879 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrlP06879 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrlP06879 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrlP06879 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PrlP06879 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrlP06879 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrlP06879 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrlP06879 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrlP06879 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrlP06879 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrlP06879 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrlP06879 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrlP06879 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrlP06879 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PrlP06879 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrlP06879 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrlP06879 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrlP06879 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrlP06879 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrlP06879 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrlP06879 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrlP06879 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrlP06879 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrlP06879 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrlP06879 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrlP06879 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrlP06879 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrlP06879 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrlP06879 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrlP06879 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrlP06879 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrlP06879 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrlP06879 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrlP06879 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PrlP06879 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PrlP06879 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrlP06879 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PrlP06879 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrlP06879 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrlP06879 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrlP06879 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrlP06879 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrlP06879 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms