Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt1P04104 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Krt1P04104 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt1P04104 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt1P04104 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt1P04104 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt1P04104 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt1P04104 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt1P04104 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt1P04104 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt1P04104 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt1P04104 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt1P04104 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt1P04104 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt1P04104 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt1P04104 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt1P04104 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt1P04104 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt1P04104 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt1P04104 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt1P04104 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt1P04104 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt1P04104 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt1P04104 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt1P04104 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt1P04104 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt1P04104 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt1P04104 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt1P04104 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt1P04104 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt1P04104 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt1P04104 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt1P04104 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt1P04104 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt1P04104 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt1P04104 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt1P04104 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt1P04104 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt1P04104 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt1P04104 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt1P04104 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt1P04104 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt1P04104 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt1P04104 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt1P04104 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt1P04104 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt1P04104 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt1P04104 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt1P04104 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt1P04104 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt1P04104 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt1P04104 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt1P04104 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt1P04104 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt1P04104 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt1P04104 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt1P04104 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt1P04104 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt1P04104 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt1P04104 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt1P04104 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt1P04104 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt1P04104 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt1P04104 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt1P04104 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt1P04104 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt1P04104 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt1P04104 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt1P04104 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt1P04104 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt1P04104 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt1P04104 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt1P04104 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt1P04104 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt1P04104 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt1P04104 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt1P04104 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt1P04104 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt1P04104 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms