Protein–RNA interactions for Protein: P02772

Afp, Alpha-fetoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfpP02772 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AfpP02772 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AfpP02772 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AfpP02772 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AfpP02772 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AfpP02772 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AfpP02772 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AfpP02772 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AfpP02772 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AfpP02772 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AfpP02772 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AfpP02772 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AfpP02772 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AfpP02772 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AfpP02772 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AfpP02772 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AfpP02772 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AfpP02772 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AfpP02772 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AfpP02772 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AfpP02772 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AfpP02772 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AfpP02772 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AfpP02772 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AfpP02772 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AfpP02772 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AfpP02772 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
AfpP02772 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AfpP02772 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AfpP02772 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AfpP02772 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AfpP02772 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AfpP02772 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AfpP02772 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AfpP02772 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AfpP02772 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AfpP02772 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AfpP02772 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AfpP02772 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AfpP02772 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AfpP02772 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AfpP02772 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AfpP02772 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AfpP02772 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AfpP02772 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AfpP02772 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AfpP02772 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AfpP02772 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AfpP02772 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
AfpP02772 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AfpP02772 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
AfpP02772 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AfpP02772 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AfpP02772 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AfpP02772 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AfpP02772 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AfpP02772 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AfpP02772 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AfpP02772 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AfpP02772 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AfpP02772 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AfpP02772 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AfpP02772 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AfpP02772 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AfpP02772 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AfpP02772 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AfpP02772 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AfpP02772 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AfpP02772 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AfpP02772 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AfpP02772 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AfpP02772 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AfpP02772 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AfpP02772 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AfpP02772 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AfpP02772 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AfpP02772 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AfpP02772 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AfpP02772 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AfpP02772 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AfpP02772 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AfpP02772 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AfpP02772 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AfpP02772 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AfpP02772 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AfpP02772 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AfpP02772 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AfpP02772 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AfpP02772 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AfpP02772 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AfpP02772 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AfpP02772 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AfpP02772 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AfpP02772 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AfpP02772 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AfpP02772 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AfpP02772 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AfpP02772 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AfpP02772 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AfpP02772 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms