Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Ab1P01921 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Ab1P01921 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Ab1P01921 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Ab1P01921 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Ab1P01921 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Ab1P01921 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Ab1P01921 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Ab1P01921 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Ab1P01921 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Ab1P01921 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Ab1P01921 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Ab1P01921 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Ab1P01921 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Ab1P01921 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Ab1P01921 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Ab1P01921 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Ab1P01921 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Ab1P01921 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Ab1P01921 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2-Ab1P01921 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-Ab1P01921 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-Ab1P01921 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Ab1P01921 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Ab1P01921 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Ab1P01921 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Ab1P01921 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Ab1P01921 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Ab1P01921 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-Ab1P01921 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-Ab1P01921 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-Ab1P01921 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-Ab1P01921 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-Ab1P01921 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-Ab1P01921 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-Ab1P01921 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-Ab1P01921 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-Ab1P01921 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-Ab1P01921 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-Ab1P01921 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-Ab1P01921 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-Ab1P01921 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-Ab1P01921 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-Ab1P01921 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-Ab1P01921 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-Ab1P01921 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-Ab1P01921 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-Ab1P01921 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-Ab1P01921 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-Ab1P01921 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-Ab1P01921 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-Ab1P01921 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-Ab1P01921 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms