Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-K1P01901 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-K1P01901 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-K1P01901 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-K1P01901 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-K1P01901 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-K1P01901 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-K1P01901 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-K1P01901 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-K1P01901 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-K1P01901 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-K1P01901 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2-K1P01901 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.29■■□□□ 1
H2-K1P01901 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-K1P01901 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-K1P01901 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-K1P01901 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-K1P01901 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
H2-K1P01901 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H2-K1P01901 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-K1P01901 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-K1P01901 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-K1P01901 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-K1P01901 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-K1P01901 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-K1P01901 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-K1P01901 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-K1P01901 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-K1P01901 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-K1P01901 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-K1P01901 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-K1P01901 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-K1P01901 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-K1P01901 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-K1P01901 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-K1P01901 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-K1P01901 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-K1P01901 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-K1P01901 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-K1P01901 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-K1P01901 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-K1P01901 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-K1P01901 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-K1P01901 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-K1P01901 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-K1P01901 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-K1P01901 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-K1P01901 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-K1P01901 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-K1P01901 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-K1P01901 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-K1P01901 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-K1P01901 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-K1P01901 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-K1P01901 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-K1P01901 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-K1P01901 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-K1P01901 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-K1P01901 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-K1P01901 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-K1P01901 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-K1P01901 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-K1P01901 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-K1P01901 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-K1P01901 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-K1P01901 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-K1P01901 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-K1P01901 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms