Protein–RNA interactions for Protein: P01837

Ig kappa chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01837 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01837 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01837 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01837 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01837 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01837 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01837 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01837 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01837 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01837 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01837 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01837 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01837 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01837 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01837 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01837 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01837 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01837 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01837 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01837 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01837 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01837 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01837 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01837 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01837 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01837 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01837 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01837 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01837 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01837 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01837 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01837 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01837 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01837 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01837 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01837 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01837 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01837 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01837 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01837 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01837 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01837 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01837 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01837 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01837 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01837 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01837 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01837 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01837 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
P01837 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01837 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01837 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01837 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01837 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01837 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01837 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01837 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01837 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01837 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01837 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01837 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01837 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01837 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01837 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01837 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01837 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01837 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01837 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01837 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01837 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01837 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01837 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01837 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01837 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01837 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01837 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01837 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01837 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01837 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01837 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01837 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01837 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01837 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01837 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01837 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01837 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01837 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01837 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01837 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01837 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01837 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01837 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01837 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01837 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01837 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01837 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01837 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01837 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01837 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01837 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms