Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc6O88978 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc6O88978 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc6O88978 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc6O88978 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc6O88978 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc6O88978 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc6O88978 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc6O88978 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc6O88978 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc6O88978 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lrrc6O88978 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc6O88978 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc6O88978 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc6O88978 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc6O88978 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc6O88978 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc6O88978 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc6O88978 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc6O88978 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc6O88978 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc6O88978 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc6O88978 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc6O88978 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc6O88978 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc6O88978 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc6O88978 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc6O88978 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc6O88978 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc6O88978 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc6O88978 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc6O88978 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc6O88978 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc6O88978 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc6O88978 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc6O88978 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc6O88978 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc6O88978 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc6O88978 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lrrc6O88978 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc6O88978 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc6O88978 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc6O88978 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc6O88978 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc6O88978 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc6O88978 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc6O88978 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc6O88978 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc6O88978 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrc6O88978 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc6O88978 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc6O88978 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc6O88978 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc6O88978 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc6O88978 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc6O88978 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrrc6O88978 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc6O88978 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc6O88978 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc6O88978 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc6O88978 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc6O88978 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc6O88978 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc6O88978 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc6O88978 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc6O88978 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc6O88978 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc6O88978 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc6O88978 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc6O88978 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc6O88978 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc6O88978 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc6O88978 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc6O88978 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms