Protein–RNA interactions for Protein: O88962

Cyp8b1, 7-alpha-hydroxycholest-4-en-3-one 12-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp8b1O88962 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp8b1O88962 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp8b1O88962 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp8b1O88962 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp8b1O88962 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp8b1O88962 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp8b1O88962 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp8b1O88962 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp8b1O88962 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp8b1O88962 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp8b1O88962 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp8b1O88962 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp8b1O88962 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp8b1O88962 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp8b1O88962 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp8b1O88962 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp8b1O88962 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp8b1O88962 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp8b1O88962 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp8b1O88962 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp8b1O88962 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp8b1O88962 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp8b1O88962 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp8b1O88962 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp8b1O88962 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp8b1O88962 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp8b1O88962 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp8b1O88962 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp8b1O88962 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp8b1O88962 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp8b1O88962 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp8b1O88962 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp8b1O88962 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp8b1O88962 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp8b1O88962 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp8b1O88962 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp8b1O88962 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp8b1O88962 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp8b1O88962 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp8b1O88962 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp8b1O88962 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp8b1O88962 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp8b1O88962 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp8b1O88962 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp8b1O88962 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp8b1O88962 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp8b1O88962 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp8b1O88962 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp8b1O88962 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp8b1O88962 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp8b1O88962 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp8b1O88962 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp8b1O88962 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp8b1O88962 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp8b1O88962 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp8b1O88962 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp8b1O88962 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp8b1O88962 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp8b1O88962 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp8b1O88962 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp8b1O88962 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp8b1O88962 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp8b1O88962 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp8b1O88962 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp8b1O88962 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp8b1O88962 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp8b1O88962 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp8b1O88962 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp8b1O88962 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp8b1O88962 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp8b1O88962 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp8b1O88962 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp8b1O88962 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp8b1O88962 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp8b1O88962 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp8b1O88962 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cyp8b1O88962 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp8b1O88962 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp8b1O88962 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp8b1O88962 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp8b1O88962 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp8b1O88962 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp8b1O88962 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp8b1O88962 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp8b1O88962 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp8b1O88962 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp8b1O88962 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp8b1O88962 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp8b1O88962 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp8b1O88962 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp8b1O88962 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp8b1O88962 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp8b1O88962 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp8b1O88962 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp8b1O88962 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp8b1O88962 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp8b1O88962 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp8b1O88962 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp8b1O88962 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp8b1O88962 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms