Protein–RNA interactions for Protein: O88904

Hipk1, Homeodomain-interacting protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk1O88904 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hipk1O88904 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hipk1O88904 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hipk1O88904 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hipk1O88904 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hipk1O88904 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hipk1O88904 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hipk1O88904 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hipk1O88904 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hipk1O88904 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hipk1O88904 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hipk1O88904 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hipk1O88904 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hipk1O88904 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hipk1O88904 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hipk1O88904 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hipk1O88904 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hipk1O88904 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hipk1O88904 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hipk1O88904 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hipk1O88904 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hipk1O88904 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hipk1O88904 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hipk1O88904 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hipk1O88904 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hipk1O88904 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hipk1O88904 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hipk1O88904 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hipk1O88904 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hipk1O88904 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hipk1O88904 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hipk1O88904 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hipk1O88904 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hipk1O88904 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hipk1O88904 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hipk1O88904 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hipk1O88904 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hipk1O88904 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hipk1O88904 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hipk1O88904 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hipk1O88904 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hipk1O88904 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hipk1O88904 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hipk1O88904 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hipk1O88904 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hipk1O88904 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hipk1O88904 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hipk1O88904 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hipk1O88904 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hipk1O88904 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hipk1O88904 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hipk1O88904 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms