Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clec11aO88200 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clec11aO88200 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clec11aO88200 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clec11aO88200 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clec11aO88200 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clec11aO88200 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clec11aO88200 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clec11aO88200 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clec11aO88200 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clec11aO88200 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clec11aO88200 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clec11aO88200 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clec11aO88200 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clec11aO88200 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Clec11aO88200 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clec11aO88200 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clec11aO88200 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clec11aO88200 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clec11aO88200 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clec11aO88200 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clec11aO88200 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clec11aO88200 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clec11aO88200 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clec11aO88200 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Clec11aO88200 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Clec11aO88200 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clec11aO88200 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clec11aO88200 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clec11aO88200 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clec11aO88200 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clec11aO88200 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clec11aO88200 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clec11aO88200 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Clec11aO88200 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clec11aO88200 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clec11aO88200 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clec11aO88200 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clec11aO88200 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clec11aO88200 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clec11aO88200 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clec11aO88200 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clec11aO88200 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Clec11aO88200 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clec11aO88200 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clec11aO88200 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clec11aO88200 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clec11aO88200 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clec11aO88200 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clec11aO88200 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clec11aO88200 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clec11aO88200 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clec11aO88200 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clec11aO88200 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Clec11aO88200 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clec11aO88200 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clec11aO88200 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clec11aO88200 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clec11aO88200 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clec11aO88200 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clec11aO88200 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clec11aO88200 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clec11aO88200 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clec11aO88200 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clec11aO88200 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clec11aO88200 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clec11aO88200 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clec11aO88200 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clec11aO88200 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clec11aO88200 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clec11aO88200 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clec11aO88200 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clec11aO88200 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clec11aO88200 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clec11aO88200 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clec11aO88200 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms