Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ChadO55226 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChadO55226 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChadO55226 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChadO55226 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChadO55226 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChadO55226 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ChadO55226 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ChadO55226 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ChadO55226 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ChadO55226 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChadO55226 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChadO55226 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChadO55226 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChadO55226 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChadO55226 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ChadO55226 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ChadO55226 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ChadO55226 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ChadO55226 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ChadO55226 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChadO55226 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChadO55226 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ChadO55226 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChadO55226 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChadO55226 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChadO55226 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChadO55226 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChadO55226 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChadO55226 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChadO55226 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChadO55226 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChadO55226 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChadO55226 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChadO55226 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChadO55226 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChadO55226 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChadO55226 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChadO55226 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChadO55226 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChadO55226 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChadO55226 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChadO55226 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChadO55226 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChadO55226 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChadO55226 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ChadO55226 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChadO55226 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChadO55226 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChadO55226 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChadO55226 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChadO55226 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChadO55226 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChadO55226 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChadO55226 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChadO55226 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChadO55226 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChadO55226 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChadO55226 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChadO55226 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChadO55226 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChadO55226 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChadO55226 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChadO55226 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChadO55226 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChadO55226 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChadO55226 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChadO55226 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChadO55226 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChadO55226 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChadO55226 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ChadO55226 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ChadO55226 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ChadO55226 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ChadO55226 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChadO55226 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ChadO55226 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChadO55226 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChadO55226 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChadO55226 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChadO55226 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChadO55226 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChadO55226 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChadO55226 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChadO55226 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChadO55226 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChadO55226 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ChadO55226 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ChadO55226 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ChadO55226 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ChadO55226 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ChadO55226 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ChadO55226 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ChadO55226 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChadO55226 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ChadO55226 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChadO55226 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ChadO55226 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ChadO55226 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ChadO55226 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.6 ms