Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nipsnap1O55125 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nipsnap1O55125 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nipsnap1O55125 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nipsnap1O55125 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap1O55125 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap1O55125 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap1O55125 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap1O55125 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap1O55125 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap1O55125 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap1O55125 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap1O55125 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap1O55125 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nipsnap1O55125 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nipsnap1O55125 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nipsnap1O55125 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nipsnap1O55125 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nipsnap1O55125 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nipsnap1O55125 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap1O55125 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nipsnap1O55125 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nipsnap1O55125 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nipsnap1O55125 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nipsnap1O55125 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1389.9 ms