Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pole2O54956 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pole2O54956 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pole2O54956 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pole2O54956 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pole2O54956 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pole2O54956 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pole2O54956 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pole2O54956 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pole2O54956 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pole2O54956 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pole2O54956 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pole2O54956 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pole2O54956 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pole2O54956 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pole2O54956 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pole2O54956 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pole2O54956 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pole2O54956 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pole2O54956 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pole2O54956 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pole2O54956 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pole2O54956 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pole2O54956 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pole2O54956 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pole2O54956 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pole2O54956 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pole2O54956 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pole2O54956 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pole2O54956 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pole2O54956 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pole2O54956 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pole2O54956 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pole2O54956 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pole2O54956 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pole2O54956 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pole2O54956 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pole2O54956 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pole2O54956 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pole2O54956 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pole2O54956 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pole2O54956 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pole2O54956 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pole2O54956 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pole2O54956 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pole2O54956 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pole2O54956 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pole2O54956 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pole2O54956 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pole2O54956 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pole2O54956 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pole2O54956 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pole2O54956 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pole2O54956 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pole2O54956 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pole2O54956 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pole2O54956 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pole2O54956 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pole2O54956 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pole2O54956 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pole2O54956 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pole2O54956 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pole2O54956 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pole2O54956 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pole2O54956 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pole2O54956 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pole2O54956 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pole2O54956 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pole2O54956 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pole2O54956 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pole2O54956 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pole2O54956 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pole2O54956 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pole2O54956 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pole2O54956 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pole2O54956 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms