Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Atp10aO54827 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Atp10aO54827 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Atp10aO54827 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Atp10aO54827 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Atp10aO54827 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Atp10aO54827 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Atp10aO54827 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Atp10aO54827 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Atp10aO54827 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Atp10aO54827 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Atp10aO54827 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Atp10aO54827 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Atp10aO54827 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Atp10aO54827 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Atp10aO54827 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Atp10aO54827 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Atp10aO54827 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Atp10aO54827 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Atp10aO54827 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Atp10aO54827 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Atp10aO54827 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Atp10aO54827 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Atp10aO54827 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Atp10aO54827 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Atp10aO54827 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Atp10aO54827 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Atp10aO54827 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Atp10aO54827 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.38
Atp10aO54827 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC36.13■■■■□ 3.38
Atp10aO54827 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Atp10aO54827 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Atp10aO54827 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Atp10aO54827 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Atp10aO54827 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Atp10aO54827 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Atp10aO54827 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Atp10aO54827 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Atp10aO54827 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Atp10aO54827 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Atp10aO54827 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Atp10aO54827 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Atp10aO54827 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Atp10aO54827 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Atp10aO54827 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Atp10aO54827 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Atp10aO54827 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Atp10aO54827 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Atp10aO54827 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Atp10aO54827 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Atp10aO54827 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Atp10aO54827 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Atp10aO54827 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Atp10aO54827 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Atp10aO54827 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Atp10aO54827 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
Atp10aO54827 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
Atp10aO54827 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Atp10aO54827 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Atp10aO54827 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Atp10aO54827 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Atp10aO54827 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Atp10aO54827 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Atp10aO54827 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Atp10aO54827 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Atp10aO54827 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Atp10aO54827 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Atp10aO54827 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Atp10aO54827 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Atp10aO54827 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Atp10aO54827 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Atp10aO54827 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Atp10aO54827 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Atp10aO54827 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Atp10aO54827 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Atp10aO54827 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Atp10aO54827 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Atp10aO54827 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Atp10aO54827 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Atp10aO54827 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Atp10aO54827 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Atp10aO54827 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Atp10aO54827 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Atp10aO54827 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Atp10aO54827 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Atp10aO54827 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Atp10aO54827 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Atp10aO54827 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Atp10aO54827 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Atp10aO54827 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Atp10aO54827 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Atp10aO54827 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Atp10aO54827 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Atp10aO54827 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Atp10aO54827 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Atp10aO54827 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Atp10aO54827 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Atp10aO54827 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Atp10aO54827 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Atp10aO54827 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms