Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SpibO35906 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SpibO35906 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SpibO35906 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SpibO35906 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SpibO35906 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SpibO35906 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SpibO35906 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SpibO35906 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SpibO35906 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SpibO35906 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SpibO35906 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SpibO35906 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SpibO35906 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SpibO35906 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SpibO35906 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SpibO35906 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SpibO35906 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SpibO35906 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SpibO35906 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SpibO35906 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SpibO35906 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SpibO35906 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SpibO35906 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SpibO35906 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SpibO35906 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SpibO35906 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SpibO35906 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SpibO35906 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SpibO35906 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SpibO35906 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SpibO35906 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SpibO35906 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SpibO35906 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SpibO35906 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SpibO35906 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SpibO35906 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SpibO35906 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SpibO35906 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SpibO35906 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SpibO35906 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SpibO35906 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SpibO35906 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SpibO35906 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SpibO35906 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SpibO35906 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SpibO35906 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SpibO35906 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SpibO35906 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SpibO35906 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SpibO35906 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SpibO35906 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SpibO35906 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SpibO35906 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SpibO35906 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SpibO35906 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SpibO35906 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SpibO35906 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SpibO35906 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SpibO35906 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SpibO35906 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SpibO35906 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SpibO35906 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SpibO35906 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SpibO35906 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SpibO35906 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SpibO35906 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SpibO35906 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SpibO35906 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SpibO35906 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SpibO35906 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SpibO35906 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SpibO35906 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SpibO35906 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SpibO35906 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SpibO35906 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SpibO35906 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SpibO35906 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SpibO35906 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SpibO35906 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SpibO35906 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SpibO35906 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SpibO35906 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SpibO35906 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SpibO35906 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SpibO35906 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SpibO35906 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SpibO35906 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SpibO35906 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SpibO35906 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SpibO35906 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SpibO35906 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SpibO35906 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SpibO35906 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SpibO35906 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SpibO35906 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SpibO35906 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SpibO35906 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SpibO35906 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SpibO35906 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms