Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PnnO35691 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PnnO35691 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PnnO35691 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PnnO35691 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PnnO35691 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PnnO35691 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PnnO35691 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PnnO35691 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PnnO35691 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PnnO35691 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PnnO35691 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PnnO35691 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PnnO35691 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PnnO35691 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PnnO35691 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PnnO35691 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PnnO35691 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PnnO35691 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PnnO35691 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PnnO35691 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PnnO35691 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PnnO35691 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PnnO35691 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PnnO35691 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PnnO35691 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PnnO35691 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PnnO35691 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PnnO35691 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PnnO35691 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PnnO35691 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PnnO35691 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PnnO35691 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PnnO35691 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PnnO35691 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PnnO35691 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PnnO35691 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PnnO35691 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PnnO35691 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PnnO35691 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PnnO35691 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PnnO35691 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PnnO35691 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PnnO35691 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PnnO35691 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PnnO35691 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PnnO35691 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PnnO35691 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PnnO35691 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PnnO35691 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PnnO35691 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PnnO35691 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PnnO35691 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PnnO35691 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PnnO35691 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PnnO35691 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PnnO35691 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PnnO35691 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PnnO35691 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PnnO35691 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PnnO35691 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PnnO35691 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PnnO35691 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PnnO35691 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PnnO35691 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PnnO35691 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PnnO35691 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PnnO35691 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PnnO35691 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PnnO35691 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PnnO35691 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PnnO35691 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PnnO35691 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PnnO35691 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PnnO35691 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PnnO35691 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PnnO35691 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PnnO35691 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PnnO35691 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PnnO35691 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PnnO35691 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PnnO35691 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PnnO35691 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PnnO35691 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PnnO35691 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PnnO35691 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PnnO35691 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PnnO35691 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PnnO35691 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PnnO35691 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PnnO35691 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PnnO35691 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PnnO35691 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PnnO35691 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PnnO35691 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PnnO35691 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PnnO35691 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PnnO35691 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PnnO35691 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PnnO35691 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms