Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lhx8O35652 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lhx8O35652 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lhx8O35652 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx8O35652 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx8O35652 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lhx8O35652 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lhx8O35652 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lhx8O35652 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lhx8O35652 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lhx8O35652 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lhx8O35652 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lhx8O35652 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lhx8O35652 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lhx8O35652 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lhx8O35652 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lhx8O35652 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lhx8O35652 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lhx8O35652 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lhx8O35652 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lhx8O35652 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lhx8O35652 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lhx8O35652 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lhx8O35652 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lhx8O35652 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lhx8O35652 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx8O35652 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx8O35652 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx8O35652 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx8O35652 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx8O35652 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lhx8O35652 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lhx8O35652 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lhx8O35652 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lhx8O35652 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lhx8O35652 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lhx8O35652 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lhx8O35652 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lhx8O35652 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lhx8O35652 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lhx8O35652 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lhx8O35652 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lhx8O35652 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lhx8O35652 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lhx8O35652 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lhx8O35652 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lhx8O35652 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lhx8O35652 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lhx8O35652 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lhx8O35652 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx8O35652 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx8O35652 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx8O35652 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx8O35652 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx8O35652 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx8O35652 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lhx8O35652 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lhx8O35652 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lhx8O35652 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lhx8O35652 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lhx8O35652 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lhx8O35652 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lhx8O35652 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lhx8O35652 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lhx8O35652 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lhx8O35652 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lhx8O35652 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lhx8O35652 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lhx8O35652 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lhx8O35652 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lhx8O35652 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lhx8O35652 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lhx8O35652 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lhx8O35652 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lhx8O35652 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lhx8O35652 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lhx8O35652 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lhx8O35652 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lhx8O35652 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lhx8O35652 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lhx8O35652 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lhx8O35652 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lhx8O35652 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lhx8O35652 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lhx8O35652 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lhx8O35652 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lhx8O35652 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lhx8O35652 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms