Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1dO35473 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1dO35473 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1dO35473 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1dO35473 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1dO35473 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1dO35473 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1dO35473 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1dO35473 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1dO35473 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1dO35473 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1dO35473 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1dO35473 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1dO35473 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1dO35473 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1dO35473 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1dO35473 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1dO35473 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1dO35473 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1dO35473 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C1dO35473 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1dO35473 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1dO35473 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1dO35473 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1dO35473 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1dO35473 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1dO35473 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1dO35473 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1dO35473 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1dO35473 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1dO35473 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1dO35473 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1dO35473 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1dO35473 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1dO35473 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1dO35473 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1dO35473 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C1dO35473 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1dO35473 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1dO35473 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C1dO35473 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1dO35473 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1dO35473 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1dO35473 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C1dO35473 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1dO35473 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1dO35473 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1dO35473 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1dO35473 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1dO35473 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1dO35473 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1dO35473 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1dO35473 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1dO35473 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C1dO35473 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1dO35473 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1dO35473 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1dO35473 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1dO35473 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1dO35473 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1dO35473 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1dO35473 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1dO35473 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1dO35473 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1dO35473 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1dO35473 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1dO35473 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1dO35473 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1dO35473 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1dO35473 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1dO35473 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1dO35473 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
C1dO35473 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1dO35473 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1dO35473 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1dO35473 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1dO35473 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1dO35473 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1dO35473 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1dO35473 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1dO35473 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1dO35473 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1dO35473 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1dO35473 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1dO35473 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1dO35473 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1dO35473 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C1dO35473 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1dO35473 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1dO35473 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1dO35473 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1dO35473 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1dO35473 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1dO35473 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C1dO35473 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1dO35473 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1dO35473 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1dO35473 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1dO35473 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1dO35473 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms