Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
C1dO35473 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
C1dO35473 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
C1dO35473 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22,04■■□□□ 1,12
C1dO35473 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22,04■■□□□ 1,12
C1dO35473 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
C1dO35473 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22,03■■□□□ 1,12
C1dO35473 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
C1dO35473 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
C1dO35473 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
C1dO35473 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22,02■■□□□ 1,12
C1dO35473 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,11
C1dO35473 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,02■■□□□ 1,11
C1dO35473 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
C1dO35473 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
C1dO35473 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
C1dO35473 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
C1dO35473 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
C1dO35473 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
C1dO35473 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1,11
C1dO35473 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
C1dO35473 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
C1dO35473 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
C1dO35473 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
C1dO35473 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
C1dO35473 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,97■■□□□ 1,11
C1dO35473 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
C1dO35473 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
C1dO35473 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,95■■□□□ 1,1
C1dO35473 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
C1dO35473 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
C1dO35473 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
C1dO35473 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
C1dO35473 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,94■■□□□ 1,1
C1dO35473 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
C1dO35473 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
C1dO35473 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21,92■■□□□ 1,1
C1dO35473 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,92■■□□□ 1,1
C1dO35473 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
C1dO35473 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21,91■■□□□ 1,1
C1dO35473 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
C1dO35473 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
C1dO35473 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
C1dO35473 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21,9■■□□□ 1,1
C1dO35473 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
C1dO35473 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21,9■■□□□ 1,1
C1dO35473 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
C1dO35473 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
C1dO35473 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21,9■■□□□ 1,1
C1dO35473 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
C1dO35473 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21,89■■□□□ 1,09
C1dO35473 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
C1dO35473 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
C1dO35473 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21,88■■□□□ 1,09
C1dO35473 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
C1dO35473 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
C1dO35473 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
C1dO35473 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21,85■■□□□ 1,09
C1dO35473 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21,85■■□□□ 1,09
C1dO35473 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
C1dO35473 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21,84■■□□□ 1,09
C1dO35473 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
C1dO35473 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21,84■■□□□ 1,09
C1dO35473 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
C1dO35473 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21,83■■□□□ 1,09
C1dO35473 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21,83■■□□□ 1,09
C1dO35473 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
C1dO35473 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,83■■□□□ 1,09
C1dO35473 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
C1dO35473 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
C1dO35473 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
C1dO35473 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21,81■■□□□ 1,08
C1dO35473 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21,8■■□□□ 1,08
C1dO35473 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
C1dO35473 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21,8■■□□□ 1,08
C1dO35473 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
C1dO35473 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21,8■■□□□ 1,08
C1dO35473 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21,8■■□□□ 1,08
C1dO35473 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
C1dO35473 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
C1dO35473 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
C1dO35473 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
C1dO35473 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
C1dO35473 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,78■■□□□ 1,08
C1dO35473 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,78■■□□□ 1,08
C1dO35473 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,78■■□□□ 1,08
C1dO35473 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21,78■■□□□ 1,08
C1dO35473 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
C1dO35473 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,78■■□□□ 1,08
C1dO35473 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
C1dO35473 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
C1dO35473 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
C1dO35473 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
C1dO35473 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,07
C1dO35473 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
C1dO35473 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
C1dO35473 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
C1dO35473 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
C1dO35473 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,75■■□□□ 1,07
C1dO35473 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21,75■■□□□ 1,07
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