Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnih1O35372 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnih1O35372 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnih1O35372 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnih1O35372 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnih1O35372 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnih1O35372 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnih1O35372 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnih1O35372 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnih1O35372 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnih1O35372 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnih1O35372 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnih1O35372 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnih1O35372 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnih1O35372 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnih1O35372 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnih1O35372 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnih1O35372 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnih1O35372 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnih1O35372 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnih1O35372 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnih1O35372 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnih1O35372 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnih1O35372 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnih1O35372 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnih1O35372 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Cnih1O35372 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cnih1O35372 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnih1O35372 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnih1O35372 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnih1O35372 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnih1O35372 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnih1O35372 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnih1O35372 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnih1O35372 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnih1O35372 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnih1O35372 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnih1O35372 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnih1O35372 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnih1O35372 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnih1O35372 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnih1O35372 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnih1O35372 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnih1O35372 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih1O35372 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih1O35372 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih1O35372 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih1O35372 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnih1O35372 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnih1O35372 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnih1O35372 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnih1O35372 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms