Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh2d1bO35324 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh2d1bO35324 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh2d1bO35324 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2d1bO35324 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2d1bO35324 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2d1bO35324 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2d1bO35324 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2d1bO35324 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2d1bO35324 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh2d1bO35324 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh2d1bO35324 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh2d1bO35324 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh2d1bO35324 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2d1bO35324 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2d1bO35324 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2d1bO35324 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2d1bO35324 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2d1bO35324 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2d1bO35324 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2d1bO35324 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2d1bO35324 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2d1bO35324 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2d1bO35324 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2d1bO35324 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2d1bO35324 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2d1bO35324 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2d1bO35324 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2d1bO35324 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2d1bO35324 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2d1bO35324 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2d1bO35324 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2d1bO35324 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2d1bO35324 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2d1bO35324 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2d1bO35324 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh2d1bO35324 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh2d1bO35324 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh2d1bO35324 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh2d1bO35324 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2d1bO35324 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2d1bO35324 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2d1bO35324 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh2d1bO35324 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sh2d1bO35324 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh2d1bO35324 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2d1bO35324 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2d1bO35324 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh2d1bO35324 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh2d1bO35324 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh2d1bO35324 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh2d1bO35324 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh2d1bO35324 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh2d1bO35324 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2d1bO35324 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2d1bO35324 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2d1bO35324 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2d1bO35324 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh2d1bO35324 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2d1bO35324 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2d1bO35324 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2d1bO35324 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh2d1bO35324 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh2d1bO35324 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh2d1bO35324 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh2d1bO35324 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh2d1bO35324 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh2d1bO35324 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh2d1bO35324 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh2d1bO35324 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh2d1bO35324 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh2d1bO35324 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh2d1bO35324 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh2d1bO35324 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh2d1bO35324 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh2d1bO35324 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh2d1bO35324 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh2d1bO35324 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh2d1bO35324 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh2d1bO35324 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh2d1bO35324 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh2d1bO35324 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh2d1bO35324 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh2d1bO35324 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh2d1bO35324 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh2d1bO35324 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh2d1bO35324 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh2d1bO35324 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh2d1bO35324 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh2d1bO35324 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh2d1bO35324 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh2d1bO35324 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh2d1bO35324 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh2d1bO35324 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh2d1bO35324 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh2d1bO35324 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh2d1bO35324 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh2d1bO35324 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh2d1bO35324 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh2d1bO35324 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms