Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gfra2O08842 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gfra2O08842 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gfra2O08842 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gfra2O08842 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gfra2O08842 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gfra2O08842 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gfra2O08842 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gfra2O08842 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gfra2O08842 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gfra2O08842 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gfra2O08842 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gfra2O08842 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gfra2O08842 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gfra2O08842 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gfra2O08842 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gfra2O08842 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gfra2O08842 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gfra2O08842 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gfra2O08842 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gfra2O08842 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gfra2O08842 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gfra2O08842 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gfra2O08842 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gfra2O08842 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gfra2O08842 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gfra2O08842 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gfra2O08842 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gfra2O08842 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gfra2O08842 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gfra2O08842 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gfra2O08842 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gfra2O08842 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gfra2O08842 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gfra2O08842 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gfra2O08842 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gfra2O08842 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gfra2O08842 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gfra2O08842 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gfra2O08842 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gfra2O08842 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gfra2O08842 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gfra2O08842 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gfra2O08842 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gfra2O08842 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gfra2O08842 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gfra2O08842 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gfra2O08842 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gfra2O08842 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gfra2O08842 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gfra2O08842 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gfra2O08842 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gfra2O08842 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gfra2O08842 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gfra2O08842 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gfra2O08842 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gfra2O08842 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gfra2O08842 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gfra2O08842 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gfra2O08842 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gfra2O08842 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gfra2O08842 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gfra2O08842 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gfra2O08842 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gfra2O08842 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gfra2O08842 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gfra2O08842 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gfra2O08842 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gfra2O08842 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gfra2O08842 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gfra2O08842 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gfra2O08842 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gfra2O08842 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gfra2O08842 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gfra2O08842 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gfra2O08842 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gfra2O08842 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gfra2O08842 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gfra2O08842 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gfra2O08842 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gfra2O08842 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gfra2O08842 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gfra2O08842 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gfra2O08842 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gfra2O08842 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gfra2O08842 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gfra2O08842 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gfra2O08842 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gfra2O08842 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gfra2O08842 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gfra2O08842 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gfra2O08842 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gfra2O08842 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gfra2O08842 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gfra2O08842 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gfra2O08842 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gfra2O08842 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gfra2O08842 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gfra2O08842 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gfra2O08842 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms