Protein–RNA interactions for Protein: L7N294

Gm8897, Predicted gene 8897 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8897L7N294 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8897L7N294 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8897L7N294 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8897L7N294 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8897L7N294 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8897L7N294 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8897L7N294 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8897L7N294 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8897L7N294 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8897L7N294 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8897L7N294 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8897L7N294 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8897L7N294 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8897L7N294 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8897L7N294 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8897L7N294 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8897L7N294 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8897L7N294 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8897L7N294 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8897L7N294 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8897L7N294 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8897L7N294 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8897L7N294 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8897L7N294 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8897L7N294 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8897L7N294 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8897L7N294 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8897L7N294 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8897L7N294 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8897L7N294 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm8897L7N294 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8897L7N294 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8897L7N294 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8897L7N294 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8897L7N294 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8897L7N294 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8897L7N294 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8897L7N294 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8897L7N294 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8897L7N294 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8897L7N294 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8897L7N294 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8897L7N294 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8897L7N294 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8897L7N294 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8897L7N294 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8897L7N294 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8897L7N294 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8897L7N294 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8897L7N294 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8897L7N294 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8897L7N294 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8897L7N294 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8897L7N294 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8897L7N294 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8897L7N294 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8897L7N294 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8897L7N294 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8897L7N294 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8897L7N294 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8897L7N294 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8897L7N294 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8897L7N294 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8897L7N294 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8897L7N294 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8897L7N294 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8897L7N294 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8897L7N294 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8897L7N294 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm8897L7N294 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms