Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21887J3QQ04 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21887J3QQ04 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms