Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20877J3QPZ4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20877J3QPZ4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20877J3QPZ4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20877J3QPZ4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20877J3QPZ4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20877J3QPZ4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20877J3QPZ4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20877J3QPZ4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20877J3QPZ4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20877J3QPZ4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20877J3QPZ4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20877J3QPZ4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20877J3QPZ4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20877J3QPZ4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20877J3QPZ4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20877J3QPZ4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20877J3QPZ4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20877J3QPZ4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20877J3QPZ4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20877J3QPZ4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20877J3QPZ4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20877J3QPZ4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20877J3QPZ4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20877J3QPZ4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20877J3QPZ4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20877J3QPZ4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20877J3QPZ4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20877J3QPZ4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20877J3QPZ4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20877J3QPZ4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20877J3QPZ4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20877J3QPZ4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20877J3QPZ4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20877J3QPZ4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20877J3QPZ4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20877J3QPZ4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20877J3QPZ4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20877J3QPZ4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20877J3QPZ4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20877J3QPZ4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm20877J3QPZ4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20877J3QPZ4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20877J3QPZ4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20877J3QPZ4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20877J3QPZ4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20877J3QPZ4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20877J3QPZ4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20877J3QPZ4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20877J3QPZ4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20877J3QPZ4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20877J3QPZ4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20877J3QPZ4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20877J3QPZ4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20877J3QPZ4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20877J3QPZ4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20877J3QPZ4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20877J3QPZ4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20877J3QPZ4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20877J3QPZ4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20877J3QPZ4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20877J3QPZ4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20877J3QPZ4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm20877J3QPZ4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20877J3QPZ4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20877J3QPZ4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20877J3QPZ4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20877J3QPZ4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20877J3QPZ4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20877J3QPZ4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20877J3QPZ4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20877J3QPZ4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20877J3QPZ4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20877J3QPZ4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20877J3QPZ4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20877J3QPZ4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20877J3QPZ4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20877J3QPZ4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
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