Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp2b1G5E829 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp2b1G5E829 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp2b1G5E829 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp2b1G5E829 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp2b1G5E829 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp2b1G5E829 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp2b1G5E829 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp2b1G5E829 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp2b1G5E829 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp2b1G5E829 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp2b1G5E829 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 339.6 ms