Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Pcf11G3X9Z4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Pcf11G3X9Z4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Pcf11G3X9Z4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Pcf11G3X9Z4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Pcf11G3X9Z4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Pcf11G3X9Z4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Pcf11G3X9Z4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Pcf11G3X9Z4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Pcf11G3X9Z4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Pcf11G3X9Z4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Pcf11G3X9Z4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Pcf11G3X9Z4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Pcf11G3X9Z4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Pcf11G3X9Z4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Pcf11G3X9Z4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Pcf11G3X9Z4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Pcf11G3X9Z4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Pcf11G3X9Z4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Pcf11G3X9Z4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Pcf11G3X9Z4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Pcf11G3X9Z4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Pcf11G3X9Z4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Pcf11G3X9Z4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Pcf11G3X9Z4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Pcf11G3X9Z4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Pcf11G3X9Z4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Pcf11G3X9Z4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Pcf11G3X9Z4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Pcf11G3X9Z4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Pcf11G3X9Z4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Pcf11G3X9Z4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Pcf11G3X9Z4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Pcf11G3X9Z4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Pcf11G3X9Z4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Pcf11G3X9Z4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Pcf11G3X9Z4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Pcf11G3X9Z4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Pcf11G3X9Z4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Pcf11G3X9Z4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Pcf11G3X9Z4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Pcf11G3X9Z4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Pcf11G3X9Z4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Pcf11G3X9Z4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Pcf11G3X9Z4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Pcf11G3X9Z4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Pcf11G3X9Z4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Pcf11G3X9Z4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Pcf11G3X9Z4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Pcf11G3X9Z4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Pcf11G3X9Z4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Pcf11G3X9Z4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Pcf11G3X9Z4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Pcf11G3X9Z4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Pcf11G3X9Z4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Pcf11G3X9Z4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Pcf11G3X9Z4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Pcf11G3X9Z4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Pcf11G3X9Z4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Pcf11G3X9Z4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Pcf11G3X9Z4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Pcf11G3X9Z4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Pcf11G3X9Z4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Pcf11G3X9Z4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Pcf11G3X9Z4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
Pcf11G3X9Z4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Pcf11G3X9Z4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Pcf11G3X9Z4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Pcf11G3X9Z4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Pcf11G3X9Z4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Pcf11G3X9Z4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Pcf11G3X9Z4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Pcf11G3X9Z4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Pcf11G3X9Z4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Pcf11G3X9Z4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Pcf11G3X9Z4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Pcf11G3X9Z4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Pcf11G3X9Z4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Pcf11G3X9Z4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Pcf11G3X9Z4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Pcf11G3X9Z4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Pcf11G3X9Z4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Pcf11G3X9Z4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Pcf11G3X9Z4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Pcf11G3X9Z4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Pcf11G3X9Z4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Pcf11G3X9Z4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Pcf11G3X9Z4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Pcf11G3X9Z4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Pcf11G3X9Z4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Pcf11G3X9Z4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Pcf11G3X9Z4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Pcf11G3X9Z4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Pcf11G3X9Z4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Pcf11G3X9Z4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Pcf11G3X9Z4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Pcf11G3X9Z4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Pcf11G3X9Z4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms