Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SprtnG3X912 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SprtnG3X912 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SprtnG3X912 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SprtnG3X912 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SprtnG3X912 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SprtnG3X912 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SprtnG3X912 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SprtnG3X912 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SprtnG3X912 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SprtnG3X912 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SprtnG3X912 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SprtnG3X912 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SprtnG3X912 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SprtnG3X912 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SprtnG3X912 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SprtnG3X912 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SprtnG3X912 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SprtnG3X912 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SprtnG3X912 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SprtnG3X912 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SprtnG3X912 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SprtnG3X912 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SprtnG3X912 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SprtnG3X912 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SprtnG3X912 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SprtnG3X912 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SprtnG3X912 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SprtnG3X912 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SprtnG3X912 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SprtnG3X912 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SprtnG3X912 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SprtnG3X912 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SprtnG3X912 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SprtnG3X912 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SprtnG3X912 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SprtnG3X912 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SprtnG3X912 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SprtnG3X912 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SprtnG3X912 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SprtnG3X912 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SprtnG3X912 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SprtnG3X912 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SprtnG3X912 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SprtnG3X912 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SprtnG3X912 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SprtnG3X912 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SprtnG3X912 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SprtnG3X912 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SprtnG3X912 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SprtnG3X912 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SprtnG3X912 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SprtnG3X912 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SprtnG3X912 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SprtnG3X912 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SprtnG3X912 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SprtnG3X912 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SprtnG3X912 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SprtnG3X912 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SprtnG3X912 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SprtnG3X912 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SprtnG3X912 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SprtnG3X912 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SprtnG3X912 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SprtnG3X912 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SprtnG3X912 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SprtnG3X912 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SprtnG3X912 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SprtnG3X912 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SprtnG3X912 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SprtnG3X912 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SprtnG3X912 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SprtnG3X912 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SprtnG3X912 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SprtnG3X912 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SprtnG3X912 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SprtnG3X912 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SprtnG3X912 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SprtnG3X912 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SprtnG3X912 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SprtnG3X912 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SprtnG3X912 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SprtnG3X912 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SprtnG3X912 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SprtnG3X912 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SprtnG3X912 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SprtnG3X912 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SprtnG3X912 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SprtnG3X912 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SprtnG3X912 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SprtnG3X912 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SprtnG3X912 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SprtnG3X912 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SprtnG3X912 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SprtnG3X912 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SprtnG3X912 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SprtnG3X912 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SprtnG3X912 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SprtnG3X912 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SprtnG3X912 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms