Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn34aG3UW52 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn34aG3UW52 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn34aG3UW52 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn34aG3UW52 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn34aG3UW52 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn34aG3UW52 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn34aG3UW52 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn34aG3UW52 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn34aG3UW52 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn34aG3UW52 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn34aG3UW52 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn34aG3UW52 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn34aG3UW52 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn34aG3UW52 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn34aG3UW52 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cldn34aG3UW52 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn34aG3UW52 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn34aG3UW52 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn34aG3UW52 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn34aG3UW52 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn34aG3UW52 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn34aG3UW52 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn34aG3UW52 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn34aG3UW52 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn34aG3UW52 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn34aG3UW52 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn34aG3UW52 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn34aG3UW52 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn34aG3UW52 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn34aG3UW52 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn34aG3UW52 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn34aG3UW52 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn34aG3UW52 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cldn34aG3UW52 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn34aG3UW52 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn34aG3UW52 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn34aG3UW52 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn34aG3UW52 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn34aG3UW52 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn34aG3UW52 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn34aG3UW52 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn34aG3UW52 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn34aG3UW52 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn34aG3UW52 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn34aG3UW52 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn34aG3UW52 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn34aG3UW52 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn34aG3UW52 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn34aG3UW52 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn34aG3UW52 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn34aG3UW52 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn34aG3UW52 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn34aG3UW52 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn34aG3UW52 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn34aG3UW52 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn34aG3UW52 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn34aG3UW52 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn34aG3UW52 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn34aG3UW52 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn34aG3UW52 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn34aG3UW52 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34aG3UW52 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34aG3UW52 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34aG3UW52 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn34aG3UW52 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn34aG3UW52 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn34aG3UW52 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn34aG3UW52 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn34aG3UW52 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn34aG3UW52 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn34aG3UW52 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms