Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srp72F8VQC1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srp72F8VQC1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srp72F8VQC1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srp72F8VQC1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srp72F8VQC1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srp72F8VQC1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srp72F8VQC1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srp72F8VQC1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srp72F8VQC1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srp72F8VQC1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srp72F8VQC1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srp72F8VQC1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srp72F8VQC1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srp72F8VQC1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srp72F8VQC1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srp72F8VQC1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Srp72F8VQC1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Srp72F8VQC1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Srp72F8VQC1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Srp72F8VQC1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srp72F8VQC1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srp72F8VQC1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Srp72F8VQC1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srp72F8VQC1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srp72F8VQC1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srp72F8VQC1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srp72F8VQC1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srp72F8VQC1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srp72F8VQC1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srp72F8VQC1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srp72F8VQC1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srp72F8VQC1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srp72F8VQC1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srp72F8VQC1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srp72F8VQC1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srp72F8VQC1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Srp72F8VQC1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srp72F8VQC1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srp72F8VQC1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srp72F8VQC1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srp72F8VQC1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srp72F8VQC1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srp72F8VQC1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srp72F8VQC1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srp72F8VQC1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srp72F8VQC1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srp72F8VQC1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srp72F8VQC1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srp72F8VQC1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srp72F8VQC1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srp72F8VQC1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srp72F8VQC1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srp72F8VQC1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Srp72F8VQC1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms